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circRNA课题技术服务八大模块

Geneseed 吉赛生物 2021-02-21

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吉赛生物拥有高通量测序、生物信息学、分子生物学、细胞生物学等技术平台,专注于circRNA相关技术与产品的研发。随着circRNA研究越来越系统全面,吉赛生物根据不同的需求与角度,将circRNA研究分为八大模块。



01 


circRNA表达分析






1.1 全转录组测序


组织或细胞中总RNA去除rRNA后进行高通量测序分析。




1.2 circRNA测序


样品经过RNase R消化去除线性RNA后,进行高通量测序分析。




1.3 外泌体测序


外泌体样品全转录组测序服务




1.4 高通量数据分析


已完成的高通量测序或芯片数据,或在线高通量测序或芯片数据的表达分析,组织/疾病特异性表达信息挖掘。




1.5 circRNA的QPCR检测


特定circRNA分子的QPCR检测服务,包括QPCR引物设计,QPCR检测。




1.6 circRNA的鉴定


特定circRNA分子的全长鉴定,RNase R耐受性测试等。


02 


circRNA功能分析






2.1 circRNA过表达


特定circRNA分子的过表达载体构建,可进行序列插入、缺失、点突变等。包含表达载体、慢病毒等。




2.2 circRNA干扰


设计与验证circRNA的siRNA,shRNA载体。




2.3 细胞功能研究


细胞增殖实验(CCK-8、MTT生长曲线分析、克隆形成);迁移侵袭能力测试(划痕实验、Transwell实验);细胞周期检测;细胞凋亡检测。




2.4 常规动物实验


过表达或干扰特定circRNA的肿瘤细胞系,裸鼠成瘤能力测试、瘤转移能力测试、耐药动物实验等。




2.5 定制型circRNA功能研究内


细胞自噬功能模型、铁死亡检测、细胞焦亡检测等。


03 


circRNA表观转录组






3.1 circRNA m6A修饰分析技术


meRIP-seq测序与分析。


04 


circRNA翻译-验证研究






4.1 circRNA中ORF预测分析与验证


circRNA中潜在的ORF、IRES元件序列分析;构建载体验证ORF的翻译情况。




4.2 翻译组学测序与分


Ribosome Profiling分析(Ribo-seq),RNC-seq测序。


05 


circRNA相互作用组学研究






5.1 circRNA-miRNA互作体系


miRNA 结合预测分析:从circRNA预测miRNA,从miRNA预测circRNA,circRNA-miRNA互作网络分析。

circRNA-miRNA相互作用的验证:anti-AGO2 RIP检测,标签法circRNA pull-down检测,FISH共定位分析。




5.2  circRNA-蛋白互作体系


RBP结合预测分析,标签法 circRNA pull-down蛋白质谱检测或westernblot检测,PPI互作网络分析。




5.3 circRNA-lncRNA互作体系


标签法 circRNA pull-down测序分析或QPCR分析,FISH共定位分析。


06 


功能circRNA筛选验证






6.1 高通量circRNA shRNA文库


SCL-1文库,筛选模型设计验证;高通量文库筛选功能分子;其他通用型shRNA文库。




6.2 定制化高通量circRNA shRNA文库


文库分子确认,定制shRNA文库,筛选模型设计验证,高通量文库筛选功能分子。


07 


circRNA定位分析


FISH定位分析,细胞组分分离后QPCR检测。


08 


circRNA高级结构分析


在线工具预测circRNA的二级结构。


吉赛生物聚焦circRNA研究细分领域,拥有分子生物、医学、计算机等多领域专业人才,已在广州科学城建立了1000多平方的实验、研发和生产场所,提供高通量测序技术、生物信息学、分子生物学、细胞生物学等实验技术和产品服务。


吉赛生物 | 致力于circRNA相关产品研发与服务

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